A igreja de Santa Clara, datada do século XV, foi mandada edificar por João Gonçalves Zarco, descobridor da Madeira e primeiro Capitão Donatário do Funchal. O espaço foi ampliado no final do mesmo século, para ficar integrado no Convento de Santa Clara, daí possuir elementos artísticos e arquitetónicos dos séculos XV, XVI e XVII. Da primitiva construção preserva-se o portal gótico em mármore e os túmulos de João Goncalves Zarco e família (esposa, filho, filha e genro).

Destaque para o sacrário de prata, executado por ourives madeirenses em 1671, a pintura decorativa e o revestimento da igreja, com azulejos designados por padrão de Marvila, considerado único na Madeira, e o mais complexo conjunto de tapete executado em oficinas portuguesas.

O Convento pertenceu originalmente a uma ordem de clausura mas está, atualmente, aberto aos visitantes, sendo possível visitar o claustro gótico, as capelas ornamentadas e a bela nave da igreja.